李文华的博客
装载NCI-60细胞系的细胞板
日前一种基于网页形式、涵盖了上千种药物的基因组靶点信息的工具出现了。该工具可帮助研究人员用于抗癌药物与其靶点的筛选，极大提高了工作效率。通过药物和基因靶点的海量数据相比较，研究者可更容易的辨别出针对不同的癌细胞具有不同效果的药物。
这个新开发的叫做“CellMiner”的软件通过国家癌症研究所癌症研究中心(NCI)所列出的60种癌细胞为基础。NCI-60细胞系是目前使用最广泛的用于抗癌药物测试的癌细胞样本群。该研究结果发表在7月16日的《 Cancer Research》。目前这一工具是免费的，用户可以通过它查询到NCI-60细胞系中已确认的22379个基因，以及20503个已分析的化合物的数据（包括102种已获美国食品和药物监督局批准的药物）。
国家癌症研究所癌症研究中心(NCI)的Yves Pommier博士说：“以前，你可能不得不雇佣一个生物信息学的研究团队来专门负责数据的整理工作，但是现在这一工具可以令任何一个研究人员都能轻易地掌握全部数据。研究人员可以利用它来分析药物反应,并对药物和药物,以及基因和基因进行比较。”
在生物医学领域，对基因的测序和分析已经变得越来越重要。但是，由此产生的大量数据为研究人员带来了难题：如何更好的使用和比较这些数据呢？随着新技术的出现，产生的数据也变得更多。因此，开发一种用来比较基因和潜在药物的工具就变得越发重要.利用这种新工具（discover.nci.nih.gov/cellminer），研究人员能够比较药物活性和基因表达的模式。CellMiner允许研究者输入大量的基因和药物数据，计算基因和药物活性部位的关联，确定显著相关的那些关联。它的数据整合能力比现有的其它方法更简单、快速、灵活。
之前的实验已经得到了一种药物的信息，现在研究人员利用这一工具分析了该特定药物与其它药物及基因表达模式的关联。根据以往的研究结果，他们比较了药物活性水平和基因表达模式，确定了一种名为“NSC732298”的待调查的化合物，现在还没有任何关于该化合物应用于结肠癌研究的报道。但根据CellMiner基于基因和药物配对的分析结果，它可能可以作为结肠癌治疗的潜在药物。在另一分析中，研究人员确定了第二种药物,名为selumetinib，它现在正用于结肠癌治疗试验,分析结果显示，它或许对黑色素瘤也有效。
Pommier说：”我们很期待其他研究人员能够更好的利用这一工具来观察基因的协同调控,基因表达的调控,以及基因表达与癌症之间的关系.”
该研究项目得到了NCI癌症研究与治疗中心的支持。